Fond je obrazovan za vršenje poslova u vezi naplate naknada i posebne naknade, te financiranja pripreme, provedbe i razvoja programa, projekata i sličnih aktivnosti u području očuvanja, održivog korištenja, zaštite i unapređivanja stanja okoliša.
U provođenju registrirane djelatnosti, Fond primjenjuje principe zakonitosti, javnosti rada, odgovornosti, efikasnosti, ekonomičnosti, profesionalne nepristranosti i neutralnosti.
Djelatnost Fonda je prikupljanje i distribucija finansijskih sredstava za zaštitu okoliša na teritoriji Federacije, poticanje i finansiranje pripreme, provedbe i razvoja programa, projekata i sličnih aktivnosti u području očuvanja, održivog korištenja, zaštite i unapređenja stanja okoliša i korištenja obnovljenih izvora energije, posebno:
- stručne i druge poslove u vezi s pribavljanjem, upravljanjem i korištenjem sredstava Fonda;
- posredovanje u vezi sa finansiranjem zaštite okoliša iz sredstava stranih država, međunarodnih finansijskih institucija i tijela te domaćih i stranih pravnih i fizičkih lica;
- pružanje stručnih usluga u vezi s finansiranjem zaštite okoliša;
- vođenje baze podataka o programima, projektima i sličnim aktivnostima u području zaštite okoliša, te potrebnim i raspoloživim finansijskim sredstvima za njihovo ostvarivanje;
- poticanje, uspostavljanje i ostvarivanje saradnje s međunarodnim i domaćim finansijskim institucijama i drugim pravnim i fizičkim licima radi finansiranja zaštite okoliša, planovima zaštite okoliša donesenim na osnovu Statuta, međunarodnim ugovorima čija je članica Bosna i Hercegovina te drugim programima i aktima u području zaštite okoliša;
- obavlja i druge poslove u vezi s poticajem i finansiranjem zaštite okoliša utvrđenih Statutom
Sredstva Fonda koriste se za finansiranje zaštite okoliša, a posebno za:
- zaštitu, očuvanje i poboljšanje kvaliteta zraka, tla, vode i mora, te ublažavanja klimatskih promjena i zaštite ozonskog omotača,
- saniranje, poticanje, izbjegavanje i smanjivanja nastajanja otpada,
- iskorištavanja vrijednih svojstava te obrade otpada,
- zaštitu i očuvanje biološke i pejzažne raznolikosti,
- provođenje energetskih programa,
- programa razminiranja,
- unapređenje i izgradnju infrastrukture za zaštitu okoliša,
- poboljšanje, praćenje i ocjenjivanje stanja okoliša te uvođenje sustava upravljanja okolinom, 9) poticanje održivog korištenja prirodnih dobara,
- poticanje održivih privrednih djelatnosti, odnosno održivog ekonomskog razvoja,
- poticanje istraživanja, razvojnih studija, programa, projekata i drugih aktivnosti, uključujući i demonstracijske aktivnosti.